Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms