Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc27Q3V036 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms