Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Obox3Q3UT54 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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