Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms