Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Acsf3Q3URE1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Acsf3Q3URE1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Acsf3Q3URE1 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Acsf3Q3URE1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Acsf3Q3URE1 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Acsf3Q3URE1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Acsf3Q3URE1 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Acsf3Q3URE1 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Acsf3Q3URE1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Acsf3Q3URE1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Acsf3Q3URE1 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Acsf3Q3URE1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Acsf3Q3URE1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Acsf3Q3URE1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Acsf3Q3URE1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Acsf3Q3URE1 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Acsf3Q3URE1 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Acsf3Q3URE1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Acsf3Q3URE1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Acsf3Q3URE1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Acsf3Q3URE1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Acsf3Q3URE1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Acsf3Q3URE1 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Acsf3Q3URE1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Acsf3Q3URE1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Acsf3Q3URE1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Acsf3Q3URE1 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Acsf3Q3URE1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms