Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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