Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
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Rnf180Q3U827 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf180Q3U827 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Rnf180Q3U827 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf180Q3U827 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
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Rnf180Q3U827 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Rnf180Q3U827 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf180Q3U827 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Rnf180Q3U827 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Rnf180Q3U827 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Rnf180Q3U827 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf180Q3U827 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf180Q3U827 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf180Q3U827 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf180Q3U827 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf180Q3U827 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf180Q3U827 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf180Q3U827 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Rnf180Q3U827 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf180Q3U827 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf180Q3U827 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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