Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 2700069I18Rik-201ENSMUST00000128815 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Gtpbp6Q3U6U5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
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Gtpbp6Q3U6U5 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20541-201ENSMUST00000173035 1406 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Gtpbp6Q3U6U5 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Gtpbp6Q3U6U5 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Gtpbp6Q3U6U5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Gtpbp6Q3U6U5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Gtpbp6Q3U6U5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Gtpbp6Q3U6U5 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
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Gtpbp6Q3U6U5 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15937-201ENSMUST00000120727 1235 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms