Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms