Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem35bQ3U0Y2 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms