Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtf3c3Q3TMP1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms