Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms