Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

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Length 128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afvQ3THW5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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