Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam107bQ3TGF2 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms