Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCH7

Cul4a, Cullin-4A, mousemouse

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4aQ3TCH7 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cul4aQ3TCH7 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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