Protein–RNA interactions for Protein: Q3I5G5

Foxi2, Forkhead box protein I2, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxi2Q3I5G5 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Foxi2Q3I5G5 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Foxi2Q3I5G5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Foxi2Q3I5G5 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Foxi2Q3I5G5 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Foxi2Q3I5G5 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Foxi2Q3I5G5 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Foxi2Q3I5G5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Foxi2Q3I5G5 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms