Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms