Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Rpusd2Q149F1 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd2Q149F1 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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