Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms