Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms