Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Pate4Q09098 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pate4Q09098 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pate4Q09098 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pate4Q09098 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pate4Q09098 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pate4Q09098 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pate4Q09098 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pate4Q09098 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pate4Q09098 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pate4Q09098 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pate4Q09098 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pate4Q09098 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pate4Q09098 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms