Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Tgm3Q08189 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms