Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms