Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NrepQ07475 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NrepQ07475 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
NrepQ07475 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NrepQ07475 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NrepQ07475 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NrepQ07475 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
NrepQ07475 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NrepQ07475 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms