Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Thbs2Q03350 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Thbs2Q03350 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Thbs2Q03350 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Thbs2Q03350 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Thbs2Q03350 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms