Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1sQ02789 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms