Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NfiaQ02780 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms