Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GscQ02591 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GscQ02591 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GscQ02591 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GscQ02591 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GscQ02591 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GscQ02591 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GscQ02591 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GscQ02591 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GscQ02591 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GscQ02591 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GscQ02591 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GscQ02591 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GscQ02591 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GscQ02591 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GscQ02591 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GscQ02591 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GscQ02591 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GscQ02591 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GscQ02591 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GscQ02591 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GscQ02591 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GscQ02591 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GscQ02591 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GscQ02591 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GscQ02591 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GscQ02591 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GscQ02591 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GscQ02591 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GscQ02591 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GscQ02591 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GscQ02591 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GscQ02591 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GscQ02591 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GscQ02591 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GscQ02591 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GscQ02591 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GscQ02591 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GscQ02591 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GscQ02591 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GscQ02591 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GscQ02591 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GscQ02591 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GscQ02591 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GscQ02591 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GscQ02591 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GscQ02591 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GscQ02591 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GscQ02591 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GscQ02591 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GscQ02591 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GscQ02591 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GscQ02591 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GscQ02591 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GscQ02591 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GscQ02591 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GscQ02591 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GscQ02591 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GscQ02591 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GscQ02591 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GscQ02591 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GscQ02591 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GscQ02591 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GscQ02591 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GscQ02591 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GscQ02591 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GscQ02591 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GscQ02591 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GscQ02591 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GscQ02591 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GscQ02591 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GscQ02591 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GscQ02591 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GscQ02591 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GscQ02591 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GscQ02591 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GscQ02591 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GscQ02591 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GscQ02591 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GscQ02591 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GscQ02591 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GscQ02591 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GscQ02591 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GscQ02591 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GscQ02591 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GscQ02591 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GscQ02591 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GscQ02591 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GscQ02591 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GscQ02591 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GscQ02591 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GscQ02591 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GscQ02591 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GscQ02591 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GscQ02591 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GscQ02591 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GscQ02591 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GscQ02591 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GscQ02591 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GscQ02591 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms