Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms