Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Grin2bQ01097 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms