Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde1bQ01065 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms