Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms