Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms