Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbp4Q00724 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms