Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms