Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

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Length 3,329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Brca2P97929 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Brca2P97929 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Brca2P97929 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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Brca2P97929 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Brca2P97929 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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