Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SmsP97355 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SmsP97355 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SmsP97355 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SmsP97355 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SmsP97355 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SmsP97355 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SmsP97355 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SmsP97355 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SmsP97355 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SmsP97355 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SmsP97355 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SmsP97355 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SmsP97355 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SmsP97355 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SmsP97355 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SmsP97355 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SmsP97355 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SmsP97355 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SmsP97355 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SmsP97355 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SmsP97355 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SmsP97355 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SmsP97355 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SmsP97355 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SmsP97355 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SmsP97355 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SmsP97355 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SmsP97355 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SmsP97355 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SmsP97355 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SmsP97355 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SmsP97355 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SmsP97355 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SmsP97355 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SmsP97355 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SmsP97355 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SmsP97355 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SmsP97355 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SmsP97355 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SmsP97355 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SmsP97355 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SmsP97355 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SmsP97355 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SmsP97355 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SmsP97355 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SmsP97355 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SmsP97355 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SmsP97355 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SmsP97355 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SmsP97355 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SmsP97355 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SmsP97355 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SmsP97355 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SmsP97355 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SmsP97355 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SmsP97355 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SmsP97355 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SmsP97355 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SmsP97355 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SmsP97355 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SmsP97355 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SmsP97355 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SmsP97355 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SmsP97355 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SmsP97355 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SmsP97355 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SmsP97355 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SmsP97355 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SmsP97355 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SmsP97355 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SmsP97355 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SmsP97355 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SmsP97355 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SmsP97355 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SmsP97355 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SmsP97355 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SmsP97355 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SmsP97355 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SmsP97355 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SmsP97355 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SmsP97355 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SmsP97355 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SmsP97355 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SmsP97355 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SmsP97355 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SmsP97355 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SmsP97355 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SmsP97355 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SmsP97355 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SmsP97355 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SmsP97355 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SmsP97355 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SmsP97355 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SmsP97355 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SmsP97355 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SmsP97355 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SmsP97355 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SmsP97355 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SmsP97355 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms