Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms