Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Otx2P80206 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Otx2P80206 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Otx2P80206 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Otx2P80206 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Otx2P80206 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Otx2P80206 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Otx2P80206 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Otx2P80206 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Otx2P80206 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx2P80206 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms