Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CiitaP79621 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CiitaP79621 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CiitaP79621 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CiitaP79621 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CiitaP79621 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CiitaP79621 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CiitaP79621 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CiitaP79621 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CiitaP79621 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CiitaP79621 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CiitaP79621 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms