Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms