Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx3P70354 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx3P70354 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx3P70354 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Msx3P70354 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx3P70354 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx3P70354 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx3P70354 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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