Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb13P70321 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb13P70321 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb13P70321 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb13P70321 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms