Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms