Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SbdsP70122 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SbdsP70122 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SbdsP70122 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SbdsP70122 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SbdsP70122 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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