Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms