Protein–RNA interactions for Protein: P63044

Vamp2, Vesicle-associated membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp2P63044 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Vamp2P63044 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vamp2P63044 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms