Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2fP61219 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms