Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2d1P61080 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2d1P61080 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2d1P61080 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2d1P61080 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2d1P61080 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2d1P61080 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2d1P61080 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2d1P61080 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2d1P61080 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2d1P61080 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2d1P61080 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2d1P61080 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2d1P61080 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2d1P61080 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2d1P61080 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2d1P61080 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2d1P61080 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2d1P61080 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2d1P61080 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2d1P61080 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2d1P61080 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2d1P61080 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2d1P61080 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2d1P61080 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2d1P61080 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2d1P61080 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2d1P61080 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2d1P61080 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2d1P61080 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2d1P61080 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2d1P61080 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2d1P61080 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2d1P61080 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2d1P61080 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2d1P61080 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2d1P61080 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2d1P61080 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2d1P61080 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2d1P61080 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2d1P61080 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2d1P61080 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ube2d1P61080 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ube2d1P61080 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ube2d1P61080 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ube2d1P61080 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ube2d1P61080 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ube2d1P61080 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ube2d1P61080 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ube2d1P61080 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ube2d1P61080 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ube2d1P61080 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2d1P61080 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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