Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms